Η Αποθήκη 5 αποτελούσε την Αποθήκη δυτικά Μεγάρου Τελωνείου. Τον Ιούνιο του 1951 αποφασίστηκε να κατασκευαστεί εντός της Αποθήκης ένα γραφείο το οποίο θα ήταν η έδρα του Τμηματάρχη Αποθηκών της ΕΖΘ. Το δωμάτιο θα σχηματιζόταν με την οικοδόμηση δύο τοίχων και τη δημιουργία δύο παραθύρων και μίας πόρτας. Το έργο παραδόθηκε στην ΕΖΘ στις 27 Ιουνίου 1951. Ο υποφάκελλος περιέχει πρωτόκολλο παραλαβής, καταστάσεις πληρωμών ημερομισθίων, μελέτη του μηχανικού Μάρκου Μπούρου, ειδοποίηση για την διακήρυξη διαγωνισμού για εργολάβο καθαριότητας, προμέτρηση εργασιών του Γραφείου, σχέδιο του Γραφείου, τελική επιμέτρηση, προϋπολογισμό δαπάνης,
Ημερήσια Διαταγή υπ' αρ. 308: η διαταγή αφορά την καλύτερη οργάνωση της σύνταξης των αποκομμάτων εργασιών για τις ομάδες της Κομιστικής Υπηρεσίας. Εμπεριέχεται πίνακας με τους αρχηγούς των ομάδων.
Ημερήσια Διαταγή υπ' αρ. 339 Ημερήσια Διαταγή υπ' αρ. 340: μετάθεση του Κ. Ζαχαράκη από την Αποθήκη 15 στην Αποθήκη 5. μετάθεση του αποθηκαρίου Ξενάκη Α. από την Αποθήκη 5 στην Αποθήκη 6. Μετάθεση του αποθηκαρίου Ν. Πασάλογλου από την Αποθήκη 6 στην Αποθήκη 13. Μετάθεση του Αποθηκαρίου Κ. Αρλέτου από την Αποθήκη 7 στην Αποθήκη 13.
Ημερήσια Διαταγή υπ' αρ. 362: σχετικά με τις εισόδους των εμπορευμάτων από συγκεκριμένες θύρες. Η διαταγή περιέχει πολλές πληροφορίες και περιγράφει με λεπτομέρεια τη λειτουργία των θυρών. Ημερήσια Διαταγή υπ' αρ. 363: κατάλογος με τις θέσεις του προσωπικού ανά Αποθήκη.
Ημερήσια Διαταγή υπ' αρ. 376: σχετικά με τον έλεγχο των Αποθηκών από τον Τμηματάρχη Τμήμα Κινήσεως Εμπορευμάτων και Τελών και τον προϊστάμενο Εξωτερικής Υπηρεσίας. Ημερήσια Διαταγή υπ' αρ. 377: Ο Ταγαράς μετατίθεται στην Αποθήκη 15 από την Αποθήκη 9. Ο Βορέας στην Αποθήκη 5.
Ημερήσια Διαταγή υπ' αρ. 393: εντολή για τη λειτουργία των Αποθηκών 1,5,6 καιν 7 Κυριακή Ημερήσια Διαταγή υπ' αρ. 394: πώληση του ιδιόκτητου χόρτου από την Υπηρεσία Στάβλων
Ημερήσια Διαταγή υπ' αρ. 477: τα σε σάκο μεταλλεύματα θα συγκεντρώνονται στην Αποθήκη 5. Η Αποθήκη 11 θα λαμβάνει εμπορεύματα που θα κατευθύνονται στην Αποθήκη 14 και 15. Ημερήσια Διαταγή υπ' αρ. 478: στην Αποθήκη 5 θα συγκεντρώνονται τα δημητριακά που έρχονται με το σιδηρόδρομο.
Ημερήσια Διαταγή υπ' αρ. 501 μεταβολές στη σύνθεση του προσωπικού Αποθηκών και Υπηρεσία Μεταφορών Ξηράς. Ημερήσια Διαταγή υπ' αρ. 502: απόφαση για παράδοση της Αποθήκης Υλικού από τον Δ. Κυπριανίδη
