Με το νέο οργανισμό της ΕΖΘ (Π.Δ. 11/5/1929) συγκροτήθηκε η Υπηρεσία Μεταφορών Ξηράς και Φορτώσεως Θαλάσσης ΕΖΘ και υπάγεται στην Εξωτερική Υπηρεσία ΕΖΘ.
Με το οργανόγραμμα του Αναγκαστικού Νόμου 962/23.11.1937, μετονομάζεται σε Τμήμα Μεταφορών ΕΖΘ και υπάγεται στην Εκμετάλλευση ΕΖΘ. Ταυτόχρονα αποκτά περισσότερες αρμοδιότητες καθώς εντάσσονται οι λειτουργίες της Υπηρεσίας Σιδηροδρομικής Κινήσεως και μερικές αρμοδιότητες του Τμήματος Εμπορευμάτων και Τελών.
Με τον οργανισμό του Β.Δ./1949-1-24, αφαιρούνται από το Τμήμα Μεταφορών οι αρμοδιότητες των παλιών Γραφείων Φορτοεκφορτώσεων Ξηράς και Φορτοεκφορτώσεων Θαλάσσης τις οποίες αναλαμβάνει το αυτόνομο νεοπαγές Τμήμα Φορτοεκφορτώσεων Ξηράς και Θαλάσσης ΕΖΘ. ταυτόχρονα, αφαιρούνται οι αρμοδιότητες της Υπηρεσίας Σιδηροδρομικής Κινήσεως καθώς η συγκεκριμένη υπηρεσία ανασυστήνεται. Ουσιαστικά, το Τμήμα Μεταφορών διατηρεί τις αρμοδιότητες του παλαιού Γραφείου Κομιστικής. Με τη συγχώνευση του ΛΤΘ και της ΕΖΘ σε ΕΖΛΘ, Η Υπηρεσία Γερανών του τέως ΛΤΘ ενσωματώνεται στο Τμήμα Μεταφορών της τέως ΕΖΘ, ενώ το τεχνικό μέρος, δηλαδή η συντήρηση και η επισκευή στην Τεχνική Υπηρεσία του τέως ΛΤΘ. Προϊστάμενος του Τμήματος Μεταφορών Αναλαμβάνει ο Ζαρίδης και όταν αυτός κωλύεται ο Κακάβας.
«