Ο Ιωάννης Εμίρης ήταν ναυτικός πράκτορας. Ο Πατέρας του Εμμανουήλ Εμίρης διέμενε στη Θεσσαλονίκη από το 1880 και διατηρούσε επιχείρηση ναυτικού πράκτορα από το 1908 και πρακτόρευε τις εταιρείες Πανταλέοντος και John Mac Dowal & Barbour. Το 1909 ο Εμίρης Ιωάννης ήταν μέλος της Διοικούσας Επιτροπής του Ναυτικού Επιμελητηρίου.
Το Γραφείο του Ιωάννη Εμίρη λειτουργούσε από το 1924 στην οδό Ναυάρχου Κουντουριώτη 50, ενώ το 1927 ήταν στην οδό Αγγλίας 7 και πρακτόρευε την Ελληνική Εταιρεία Σύρου και την Ακτοπλοΐα Ελλάδος Α.Ε. Από το 1909 ήταν μέλος του Ναυτικού Επιμελητηρίου Θεσσαλονίκης και από το 1924 μέλος του ΔΣ μέχρι και το 1931. Ήταν μέλος του ΔΣ του Ελληνικού Ερυθρού Σταυρού, μάλιστα την κρίσιμη περίοδο της Κατοχής. Επίσης ήταν μέλος του ΔΣ της ΧΑΝΘ, της ΧΕΝΘ και του Ναυτικού Ομίλου. Ο Ιωάννης Εμίρης διετέλεσε εκπρόσωπός του Ναυτικού Επιμελητηρίου στην Επιτροπεία της ΕΖΘ από 16 Απριλίου 1930 έως 27 Ιανουαρίου 1932 και του ΛΤΘ από την συγκρότησή της στις 27 Ιανουαρίου 1930. Αποχώρησε από τη διοίκηση των οργανισμών στις 27 Ιανουαρίου 1932. Απεβίωσε το 1954.