Τμήμα Επισκευών και Συντήρησης Έργων
Με το ΠΔ 197/9.5.1988 συστήνεται Τμήμα Επισκευών και Συντήρησης Έργων ως μέρος στη Διεύθυνση Δομικών Έργων αναλαμβάνοντας μέρος των λειτουργιών του Τμήματος τεχνικών Κατασκευών ΟΛΘ.
Με βάση την απόφαση της Επιτροπείας ΕΖΘ της 1ης Σεπτεμβρίου 1926 και την Ημερήσια Διαταγή υπ. αριθ. 77 στις 2 Σεπτεμβρίου 1926 συστήνεται Τμήμα Ελέγχου ΕΖΘ στο οποίο τοποθετούνται ο Χαράλαμπος Μιχαηλίδης ως προϊστάμενος ενώ παράλληλα παραμένει προϊστάμενος στο Τμήμα Στατιστικής, καθώς και οι Αχιλλέας Γουλιανός και Αριστοτέλης Βέλκος από το Τμήμα Εμπορευμάτων και Τελών και ο Δημήτριος Τριανταφύλλου από το Τμήμα Λογιστικής. Το Τμήμα λειτουργεί ενιαία ως Τμήμα Ελέγχου και Στατιστικής. Με βάση το οργανόγραμμα του Π.Δ.1929-5-11, λειτουργεί Τμήμα Ελέγχου το οποίο υπάγεται στην Εσωτερική Υπηρεσία. Στις 11 Ιουλίου 1929 η Επιτροπεία ΕΖΘ αποφασίζει το διαχωρισμό του Τμήματος Ελέγχου από το Τμήμα Στατιστικής και ο διαχωρισμός υλοποιείται με την Ημερήσια Διαταγή 514. Με βάση το οργανόγραμμα του Α.Ν. 962/23-11-1937 εντάσσεται στη Διοίκηση ΕΖΘ.
Με το ΠΔ 197/9.5.1988 συστήνεται Τμήμα Εκπαίδευσης ΟΛΘ υπαγόμενο στην Διεύθυνση Διοικητικού ΟΛΘ.
Τμήμα Εκμετάλλευσης Γαλλικής Εταιρίας Εκμεταλλεύσεως Λιμένος Θεσσαλονίκης
Στις 16/1/1905, η Ανώνυμος Οθωμανική Εταιρεία Κατασκευής του Λιμένος Θεσσαλονίκης με απόφαση της Γενικής Συνέλευσης των μετόχων μετονομάστηκε σε Société ottomane d’exploitation du port de Salonique (Ανώνυμος Οθωμανική Εταιρεία Εκμεταλλεύσεως του Λιμένος Θεσσαλονίκης). (Gil Blas, 13/1/1/1905, 11/2/1905) Τότε λογικά συστάθηκε το Τμήμα Εκμετάλλευσης Γαλλικής Εταιρίας Εκμεταλλεύσεως Λιμένος Θεσσαλονίκης στις 1930-02-20 με μια τελετή παράδοσης οι υπηρεσίες της Γαλλικής Εταιρίας μεταφέρθηκαν στο νεοσύστατο Λιμενικό Ταμείο Θεσσαλονίκης (ΛΤΘ)
Τμήμα Εισαγωγής και Αποταμίευσης ΕΖΘ
Με τον οργανισμό του Β.Δ./1949-1-24, συστήνεται το Τμήμα Εισαγωγής και Αποταμιεύσεως. Ουσιαστικά, αποτελεί ανασύσταση του παλαιού Τμήματος Εμπορευμάτων και Τελών καθώς αναλαμβάνεις τις σχετικές αρμοδιότητες από το Τμήμα Αποθηκεύσεως Εμπορευμάτων ΕΖΘ.
Τμήμα Διοίκησης Εργατικού Δυναμικού ΟΛΘ
Με το ΠΔ 197/9.5.1988 ονομάζεται Τμήμα Διοίκησης Εργατικού Δυναμικού ΟΛΘ υπαγόμενο στην Διεύθυνση Διοικητικού ΟΛΘ.