Τμήμα Λογιστηρίου και Ελέγχου ΛΤΘ
Ο νέος οργανισμός λειτουργίας του ΛΤΘ θα κατατεθεί τον Μάρτιο του 1935 και με βάση αυτόν το Λογιστήριο θα μετονομαστεί σε Τμήμα Λογιστηρίου και Ελέγχου αναλαμβάνοντας και τις αρμοδιότητες εσωτερικού ελέγχου. Με βάση τον "Οργανισμό Υπηρεσιών του ΛΤΘ" (16/11/1938), το Τμήμα Λογιστηρίου και Ελέγχου ΛΤΘ διασπάται σε δύο αυτόνομα Τμήματα τα οποία υπάγονται στην Υπηρεσία Οικονομικών Υπηρεσιών ΛΤΘ.
Τμήμα Κοστολόγησης - Τιμολόγησης ΟΛΘ
Με το Ν.Δ 449/1970 και το Διάταγμα 1955/12/3, λειτουργεί το Γ4 Τμήμα Τιμολογίων και Διαχείρισης Κομιστικής ΟΛΘ ως μέρος της Γ΄Διεύθυνσης Ελευθέρας Ζώνης ΟΛΘ. Με βάση το ΠΔ 197/1988, μετονομάζεται σε Τμήμα Κοστολόγησης - Τιμολόγησης ΟΛΘ ως μέρος στη Διεύθυνση Ανάπτυξης ΟΛΘ.
Τμήμα Κινήσεως Εμπορευμάτων και Τελών ΕΖΘ
Με βάση το Π.Δ. 25/10/1925 συστήνεται Τμήμα Εμπορευμάτων και Τελών. Με βάση το Π.Δ. 11/5/1929 ονομάζεται Τμήμα Κινήσεως Εμπορευμάτων και Τελών. Επίσης, υπάρχει η δυνατότητα εάν οι ανάγκες της υπηρεσίας το απαιτούν να χωριστεί σε δύο τμήματα. Με βάση τον Α.Ν. 962/23-11-1937, το Τμήμα παύει να υφίσταται και οι λειτουργίες του μεταφέρονται στο Τμήμα Μεταφορών και το Τμήμα Αποθηκεύσεως.
Με το Ν.Δ 449/1970 και το Διάταγμα 1955/12/3, λειτουργεί το Δ2 Τμήμα Τεχνικών Κατασκευών ΟΛΘ ως μέρος της Δ΄ Διεύθυνσης Τεχνικών Υπηρεσιών ΟΛΘ. Με το ΠΔ 197/9.5.1988 μετονομάζεται σε Τμήμα Τεχνικών Κατασκευών ΟΛΘ ως μέρος στη Διεύθυνση Δομικών Έργων, ενώ ένα μέρος των λειτουργιών του μεταφέρονται στο νεοσύστατο Τμήμα Επισκευών και Συντήρησης Έργων ΟΛΘ στην ίδια Διεύθυνση.
Τμήμα Κατασκευής Νέων Έργων και Συντήρησης των Υπαρχόντων ΛΤΘ
Ένας νέος και πολύ πιο πλήρης "Οργανισμό Υπηρεσιών του ΛΤΘ" κατατέθηκε στις 16 Νοεμβρίου 1938. Με αυτόν συντάχθηκε ένας ευρύς χάρτης με τη δομή, τις λειτουργίες και τους κανονισμούς. Η σημαντικότερη αλλαγή αφορούσε την ενίσχυση της Τεχνικής Υπηρεσίας υπηρετώντας το προσανατολισμό του ΛΤΘ ως λιμενικό οργανισμό τεχνικών έργων. Στο πλαίσιο αυτό συστάθηκε το Τμήμα Κατασκευής Νέων Έργων και Συντήρησης των Υπαρχόντων ΛΤΘ το οποίο υπάγεται στην Τεχνική Υπηρεσία.
Με το ΠΔ 197/9.5.1988 συστήνεται Τμήμα Κίνησης Μηχανημάτων ΟΛΘ το οποίο υπάγεται στη Διεύθυνση Ηλεκτρομηχανολογικού ΟΛΘ.
Τμήμα Κίνησης Εμπορευμάτων ΟΛΘ
Με το Ν.Δ 449/1970 και το Διάταγμα 1955/12/3, συστήνεται το Γ3 Τμήμα Κινήσεως Εμπορευμάτων ΟΛΘ ως μέρος στη Γ΄Διεύθυνσις Ελευθέρας Ζώνης ΟΛΘ (1970-1988)
Με βάση το ΠΔ 197/1988, μετονομάζεται σε Διεύθυνση Ελεύθερης Ζώνης και Λιμενικών Λειτουργιών ΟΛΘ ως μέρος στη Διεύθυνση Ελεύθερης Ζώνης και Λιμενικών Λειτουργιών ΟΛΘ.
Τμήμα Ηλεκτρομηχανολογικού ΟΛΘ
Με το ΠΔ 197/9.5.1988 συστήνεται Τμήμα Ηλεκτρομηχανολογικού ΟΛΘ το οποίο υπάγεται στη Διεύθυνση Ηλεκτρομηχανολογικού ΟΛΘ.
Με το ΠΔ 197/9.5.1988 συστήνεται Τμήμα Ηλεκτρολογικού ΟΛΘ το οποίο υπάγεται στη Διεύθυνση Ηλεκτρομηχανολογικού ΟΛΘ.